248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1078 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 309 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  62.5 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  63.23 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  47.8 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  44.22 
 
 		 313 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  37.63 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.42 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 312 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 309 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  27.44 
 
 		 332 aa  85.9  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.88 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.02 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  27.98 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.82 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28.09 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.88 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  25.98 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.38 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  26.74 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.14 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  26.75 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.5 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  27.35 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.74 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 597 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  26.95 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 801 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 750 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.09 
 
 		 853 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.09 
 
 		 853 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.36 
 
 		 851 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.36 
 
 		 851 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.86 
 
 		 851 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  23.36 
 
 		 851 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.86 
 
 		 851 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.76 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  31.06 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.76 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  28.46 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 326 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.36 
 
 		 853 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  27.59 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 242 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 250 aa  53.9  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 596 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 347 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>