More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4080 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.13 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  45.25 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 
329 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
322 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 
330 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  43.5 
 
 
310 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  40.61 
 
 
308 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
309 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
315 aa  125  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.88 
 
 
313 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
306 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.33 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  34.36 
 
 
332 aa  109  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 
309 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 
299 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
313 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  36.36 
 
 
339 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
308 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.66 
 
 
321 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
307 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  29.86 
 
 
313 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
298 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  28.47 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  28.89 
 
 
326 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
334 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
298 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.74 
 
 
325 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
234 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  27.16 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  25.74 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
1171 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.63 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.72 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  27.23 
 
 
237 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.17 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.49 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  29.65 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 
801 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
347 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  26.32 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.85 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  28.94 
 
 
392 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  24.51 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  24.32 
 
 
357 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.73 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
584 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
313 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.81 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  30.91 
 
 
287 aa  59.7  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
377 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
347 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.43 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.42 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
272 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
397 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.85 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  23.85 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
280 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>