More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4543 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  97.28 
 
 
257 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  91.8 
 
 
252 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  76.89 
 
 
255 aa  337  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  73.5 
 
 
250 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  75.86 
 
 
247 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  61.92 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  56.25 
 
 
249 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  58.33 
 
 
245 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  60.67 
 
 
252 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  60.92 
 
 
251 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  56.25 
 
 
253 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  59.39 
 
 
252 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.07 
 
 
243 aa  248  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  53.04 
 
 
248 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  54.96 
 
 
243 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  52.48 
 
 
255 aa  238  5.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  55.79 
 
 
249 aa  231  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  52.17 
 
 
240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  49.16 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  47.52 
 
 
243 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  48.18 
 
 
250 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.13 
 
 
244 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  51.3 
 
 
240 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 
247 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.78 
 
 
240 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  47.33 
 
 
247 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  52.63 
 
 
258 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  47.44 
 
 
243 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  46.69 
 
 
243 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  48.9 
 
 
240 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
243 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  45.23 
 
 
248 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
243 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.56 
 
 
247 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  44.49 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  47.01 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  47.6 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.96 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  47.41 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  46.72 
 
 
237 aa  198  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.5 
 
 
243 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 
238 aa  191  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  44.72 
 
 
249 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.16 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 
236 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 
249 aa  164  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  39.21 
 
 
240 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  38.77 
 
 
242 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.55 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.33 
 
 
240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  36.4 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  43.98 
 
 
230 aa  138  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
234 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  39.15 
 
 
343 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  41.43 
 
 
333 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 
343 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
342 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 
321 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
336 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
319 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
337 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 
314 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 
317 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
568 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  35.24 
 
 
320 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  37.02 
 
 
310 aa  124  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  35.62 
 
 
324 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
320 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
314 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
320 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
320 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
336 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
336 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
312 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
320 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
324 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
313 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
310 aa  122  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  36.54 
 
 
310 aa  121  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  37.71 
 
 
368 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  37.98 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
324 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
337 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
314 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.64 
 
 
332 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
335 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  29.46 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
329 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>