More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3676 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.23 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  57.94 
 
 		 243 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  57.94 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.51 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  57.51 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 243 aa  275  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 252 aa  274  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.36 
 
 		 243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  55.36 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.24 
 
 		 243 aa  254  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  54.08 
 
 		 249 aa  251  5.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.94 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  52.79 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.79 
 
 		 245 aa  245  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  49.16 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  54.42 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  51.06 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  50.87 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  48.7 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  48.7 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  51.08 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  49.13 
 
 		 237 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  50.43 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  48.07 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  48.07 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  45.65 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  44.77 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  45.73 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  47.35 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  48.28 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  46.22 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  45.69 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  45.58 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  45.8 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  46.02 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  46.12 
 
 		 243 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  42.68 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.06 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  41.95 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.7 
 
 		 240 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  37.83 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  39.3 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 		 314 aa  148  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  35.68 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  36.97 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 		 320 aa  135  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  33.91 
 
 		 347 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 312 aa  131  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  34.18 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 329 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 342 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 329 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  35.74 
 
 		 313 aa  124  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 		 341 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 331 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  36.97 
 
 		 315 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 320 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 		 368 aa  123  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 349 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 320 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  34.6 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 310 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 324 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 568 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  36 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  34.73 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 335 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 336 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  33.19 
 
 		 347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>