More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3976 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
325 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  87.04 
 
 
333 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  76.49 
 
 
332 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  74.61 
 
 
331 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  74.61 
 
 
331 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  73.62 
 
 
341 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  73.97 
 
 
350 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  73.52 
 
 
344 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  76.07 
 
 
340 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  73.65 
 
 
347 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  73.83 
 
 
344 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  76.07 
 
 
345 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  76.07 
 
 
345 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  76.07 
 
 
345 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  75.08 
 
 
349 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  74.19 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  66.98 
 
 
320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  66.67 
 
 
320 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  60 
 
 
310 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  59.15 
 
 
314 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  59.49 
 
 
312 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  61.82 
 
 
312 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  62.33 
 
 
312 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  60.98 
 
 
312 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.3 
 
 
327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.99 
 
 
327 aa  301  9e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
326 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50 
 
 
327 aa  299  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  48.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  48.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  48.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.3 
 
 
322 aa  299  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.3 
 
 
322 aa  298  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.99 
 
 
322 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.32 
 
 
327 aa  292  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.32 
 
 
327 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.32 
 
 
327 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.32 
 
 
327 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.32 
 
 
327 aa  292  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  49.35 
 
 
327 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  49.84 
 
 
340 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  50 
 
 
339 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.68 
 
 
331 aa  288  7e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  50 
 
 
339 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  48.55 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  49.19 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  49.19 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3616  glycosyl transferase family protein  45.18 
 
 
312 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.874932  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
320 aa  205  8e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
324 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  36.66 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
320 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
320 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
366 aa  199  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  36.62 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
364 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 
335 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  33.23 
 
 
346 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3225  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
312 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163276  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 
347 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 
320 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
330 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
330 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
337 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  36.01 
 
 
320 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
339 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  36 
 
 
312 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  35.67 
 
 
314 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
350 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  34.98 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  35.26 
 
 
341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  35.28 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  35.35 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 
339 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
336 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.14 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
334 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
357 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  36.77 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  33.44 
 
 
320 aa  178  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 
338 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.44 
 
 
319 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 
318 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
314 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>