More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1174 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
240 aa  501  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  70 
 
 
240 aa  368  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  72.69 
 
 
242 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  63.18 
 
 
243 aa  330  9e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  62.82 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  58.19 
 
 
237 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  52.56 
 
 
237 aa  271  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  43.29 
 
 
234 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  42.79 
 
 
314 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 
320 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  42.61 
 
 
320 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
324 aa  206  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 
321 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.15 
 
 
243 aa  201  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  44.89 
 
 
568 aa  201  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  42.6 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  42.17 
 
 
320 aa  198  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 
320 aa  197  9e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  41.3 
 
 
342 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 
314 aa  194  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  43.24 
 
 
329 aa  193  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  45.05 
 
 
343 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  41.77 
 
 
337 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  42.36 
 
 
249 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  42.34 
 
 
314 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
237 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  43.05 
 
 
320 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
237 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
314 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
237 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 
335 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
336 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  41.7 
 
 
320 aa  188  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
336 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
324 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  40.72 
 
 
334 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  41.85 
 
 
337 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  43.05 
 
 
329 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  44.98 
 
 
258 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  44 
 
 
339 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
368 aa  185  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  45.5 
 
 
318 aa  185  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  40.93 
 
 
240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  38.1 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  38.12 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 
320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  41.45 
 
 
250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
312 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  43.17 
 
 
245 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  40.93 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.79 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  38.94 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.33 
 
 
317 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  41.89 
 
 
316 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 
331 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  41.52 
 
 
319 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  40.89 
 
 
310 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
310 aa  176  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
331 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 
343 aa  175  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  40.43 
 
 
240 aa  175  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  38.43 
 
 
313 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 
337 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  41.1 
 
 
343 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  38.2 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  40.85 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  39.83 
 
 
245 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.15 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 
325 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 
315 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
329 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 
237 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
344 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  41.36 
 
 
318 aa  170  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
323 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 
310 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
324 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
312 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
325 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.67 
 
 
243 aa  168  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  38.12 
 
 
314 aa  168  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  38.22 
 
 
313 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 
323 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  38.22 
 
 
310 aa  165  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 
237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 
336 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.27 
 
 
247 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  40.51 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>