More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2387 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  97.71 
 
 
350 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  100 
 
 
347 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0925  glycosyl transferase family protein  86.96 
 
 
349 aa  620  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  90.31 
 
 
335 aa  600  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  85.63 
 
 
341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  89.46 
 
 
344 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  89.46 
 
 
344 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  88.29 
 
 
340 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  87.08 
 
 
345 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  89.68 
 
 
345 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  89.68 
 
 
345 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  78.05 
 
 
332 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  80.46 
 
 
331 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  80.13 
 
 
331 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4590  Undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  74.35 
 
 
333 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00472889  decreased coverage  0.00198336 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  67.95 
 
 
320 aa  457  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3976  glycosyl transferase family protein  73.65 
 
 
325 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  68.59 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1411  glycosyl transferase family protein  59.11 
 
 
314 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  60.62 
 
 
310 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  59.52 
 
 
312 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  61.31 
 
 
312 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  60.07 
 
 
312 aa  354  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0280  glycosyl transferase family 2  55.59 
 
 
312 aa  354  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.94 
 
 
322 aa  319  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  52.94 
 
 
322 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  52.94 
 
 
322 aa  319  6e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.94 
 
 
322 aa  319  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  52.94 
 
 
322 aa  319  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.94 
 
 
322 aa  319  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.94 
 
 
322 aa  318  7e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.94 
 
 
322 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.37 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.32 
 
 
327 aa  311  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  50.31 
 
 
327 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
327 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
327 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
327 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.63 
 
 
327 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.77 
 
 
327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.44 
 
 
327 aa  305  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0925  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.39 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.937263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  51.31 
 
 
327 aa  298  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  52.12 
 
 
339 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1351  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  53.8 
 
 
327 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  51.79 
 
 
339 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2927  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  52.65 
 
 
327 aa  288  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 
337 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  48.76 
 
 
340 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3616  glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
312 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.874932  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  38.59 
 
 
321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0301  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 
320 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
324 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
364 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 
337 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4310  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
320 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
320 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
366 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  32.06 
 
 
346 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  35.81 
 
 
320 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
342 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
330 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
330 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.35 
 
 
320 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  39.35 
 
 
320 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  34.49 
 
 
343 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
320 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
350 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
320 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
360 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
320 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  36.42 
 
 
320 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
341 aa  182  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 
339 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
347 aa  182  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
324 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0334  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.55 
 
 
319 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.954695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
321 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
336 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  33.97 
 
 
339 aa  180  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  32.57 
 
 
330 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
338 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
327 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
324 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
312 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
314 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  32.35 
 
 
330 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>