More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2203 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
315 aa  642    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  85.44 
 
 
312 aa  554  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  84.52 
 
 
310 aa  542  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  82.85 
 
 
310 aa  537  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  81.61 
 
 
310 aa  530  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  79.35 
 
 
313 aa  521  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  76.45 
 
 
310 aa  497  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  49.23 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  50.8 
 
 
320 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.8 
 
 
320 aa  317  2e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  51.61 
 
 
368 aa  316  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  48.4 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  48.86 
 
 
358 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  46.43 
 
 
320 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  45.96 
 
 
341 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  47.8 
 
 
329 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 
320 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  47.78 
 
 
337 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 
320 aa  293  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 
320 aa  291  8e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  47.1 
 
 
337 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  46.82 
 
 
320 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  46.23 
 
 
336 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  47.6 
 
 
320 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  47.92 
 
 
320 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  45.82 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
342 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  45.15 
 
 
343 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 
336 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  46.47 
 
 
336 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  45.31 
 
 
398 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
324 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  47.57 
 
 
336 aa  278  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  44.59 
 
 
338 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  44.37 
 
 
347 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  44.97 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 
329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  44.84 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  45.81 
 
 
318 aa  273  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  44.23 
 
 
314 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  46.13 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 
344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  44.27 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.19 
 
 
316 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
314 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 
314 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  43.08 
 
 
339 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  44.96 
 
 
302 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  41.75 
 
 
313 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  44.84 
 
 
316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  48.18 
 
 
333 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  42.26 
 
 
334 aa  250  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  44.84 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  39.88 
 
 
568 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 
325 aa  240  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 
334 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  39.16 
 
 
332 aa  229  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
319 aa  218  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  41.36 
 
 
318 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
318 aa  216  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
324 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  34.87 
 
 
317 aa  206  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
315 aa  205  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
337 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
323 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.5 
 
 
317 aa  201  9e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  34.28 
 
 
325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  36.36 
 
 
328 aa  197  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
318 aa  194  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
312 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 
331 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
323 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.59 
 
 
326 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.16 
 
 
327 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.85 
 
 
327 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  32.81 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
326 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.96 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.96 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.96 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
322 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.96 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.96 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  33.33 
 
 
322 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
322 aa  177  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
322 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 
322 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
234 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.3 
 
 
240 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.02 
 
 
322 aa  175  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.75 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  35.74 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.02 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  42.41 
 
 
249 aa  172  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>