More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5587 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
247 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  87.45 
 
 
247 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  78.69 
 
 
247 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  57.87 
 
 
240 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  54.94 
 
 
238 aa  249  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  56.47 
 
 
240 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  55.6 
 
 
258 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.42 
 
 
244 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  54.1 
 
 
240 aa  241  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.67 
 
 
243 aa  241  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  52.56 
 
 
243 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  51.71 
 
 
243 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  52.34 
 
 
243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.56 
 
 
243 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  52.34 
 
 
243 aa  239  4e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  53.22 
 
 
249 aa  238  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  51.71 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.34 
 
 
243 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  53.69 
 
 
240 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  50.85 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.07 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  50.43 
 
 
245 aa  231  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  49.36 
 
 
255 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  50.86 
 
 
237 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  48.48 
 
 
237 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  48.77 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.73 
 
 
245 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  48.96 
 
 
252 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  47.95 
 
 
253 aa  214  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  50.84 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  48.56 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  48.48 
 
 
258 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  47.93 
 
 
250 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  46.72 
 
 
251 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  49.32 
 
 
236 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  48.36 
 
 
255 aa  204  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  46.55 
 
 
248 aa  204  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  48.99 
 
 
248 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  49.33 
 
 
252 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  47.01 
 
 
252 aa  197  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
250 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  47.66 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  46.22 
 
 
243 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  47.66 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  49.16 
 
 
247 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  49.39 
 
 
250 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.66 
 
 
240 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  40.95 
 
 
243 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.25 
 
 
237 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 
240 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  38.1 
 
 
237 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  39.92 
 
 
249 aa  150  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
320 aa  142  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
342 aa  138  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
320 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  37.32 
 
 
313 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  35.44 
 
 
320 aa  138  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 
321 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  39.52 
 
 
333 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  38.6 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 
343 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  37.97 
 
 
336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
329 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  36.84 
 
 
310 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
310 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
320 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
343 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  34.93 
 
 
310 aa  125  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
341 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
312 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
335 aa  125  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
324 aa  124  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
337 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 
368 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
314 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
310 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  35.93 
 
 
329 aa  123  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
314 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
568 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  30.26 
 
 
237 aa  122  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
329 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  32.48 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
237 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 
316 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
338 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.26 
 
 
332 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  32.51 
 
 
328 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
398 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>