More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2075 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  91.16 
 
 
249 aa  463  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  80.72 
 
 
251 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  80.32 
 
 
250 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  80.32 
 
 
252 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  79.18 
 
 
245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  83.41 
 
 
252 aa  400  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  65.95 
 
 
250 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  63.9 
 
 
255 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  58.8 
 
 
252 aa  289  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  56.25 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  57.5 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  65.8 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  54.36 
 
 
248 aa  275  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  57.44 
 
 
243 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  57.14 
 
 
249 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.27 
 
 
243 aa  245  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  47.54 
 
 
255 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  51.69 
 
 
240 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  51.27 
 
 
240 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  48.35 
 
 
243 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
243 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
243 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  49.39 
 
 
247 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
243 aa  224  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.93 
 
 
243 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.54 
 
 
243 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.5 
 
 
244 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  48.16 
 
 
245 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  47.86 
 
 
243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  47.86 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  52.19 
 
 
258 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  45.73 
 
 
237 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  46.81 
 
 
237 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  45.38 
 
 
255 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.95 
 
 
247 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  50.2 
 
 
250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 
238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 
247 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  45.12 
 
 
248 aa  209  4e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  49.12 
 
 
240 aa  205  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.56 
 
 
240 aa  205  7e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.1 
 
 
245 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  44.65 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 
249 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.65 
 
 
240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 
243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
240 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.14 
 
 
237 aa  169  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
336 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  40.08 
 
 
336 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 
320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  39.48 
 
 
336 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 
324 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
320 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  37.71 
 
 
242 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 
321 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 
320 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  39.83 
 
 
342 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  37.82 
 
 
343 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
320 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
320 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
234 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 
320 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  40.28 
 
 
230 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
335 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  39.21 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
337 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  37 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
336 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  37.5 
 
 
329 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
343 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  36 
 
 
314 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  42.65 
 
 
333 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 
319 aa  138  7e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  37.86 
 
 
310 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  40.27 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
312 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  36.41 
 
 
310 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  37.23 
 
 
334 aa  135  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  36.29 
 
 
347 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
338 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 
310 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
314 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 
337 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
237 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
329 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
237 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
319 aa  132  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
341 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
331 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>