More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1536 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  64.41 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.79 
 
 		 244 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  55.98 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  59.21 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  56.78 
 
 		 240 aa  254  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  54.08 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  56.54 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  55.22 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  57.45 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.81 
 
 		 243 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  57.14 
 
 		 253 aa  248  9e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  54.78 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.85 
 
 		 243 aa  244  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  55.7 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  53.42 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  53.42 
 
 		 243 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  53.42 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  54.08 
 
 		 247 aa  241  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  52.59 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  52.79 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  52.16 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  54.15 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.22 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  52.16 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  53.51 
 
 		 251 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  56.7 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  53.68 
 
 		 245 aa  235  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  58.05 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  53.28 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  56.19 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  59.31 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  51.75 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  55.7 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  50.65 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  47.83 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  56.52 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  55.26 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  50.22 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  47.21 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.72 
 
 		 245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  48.29 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  48.09 
 
 		 248 aa  205  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  47.19 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  42.36 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  46.93 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  41.05 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.87 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.43 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  41.05 
 
 		 237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  40.61 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  37.39 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  38.3 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  42.13 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 		 329 aa  158  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  40.43 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 310 aa  156  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 337 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 		 320 aa  155  7e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 336 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.97 
 
 		 316 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  45.11 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  38.3 
 
 		 321 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 		 336 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  36.6 
 
 		 320 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 		 315 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  38.08 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  38.77 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  32.16 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 314 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 568 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  34.15 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  35.74 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  34.62 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 		 358 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>