More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2555 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  93.25 
 
 		 252 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  90.4 
 
 		 250 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  82.73 
 
 		 251 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  80.72 
 
 		 253 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  80.82 
 
 		 249 aa  407  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  76.54 
 
 		 245 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  69.71 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  68.49 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  60.09 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  70.13 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  60.79 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  60.79 
 
 		 257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  54.44 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.98 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 		 243 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  57.14 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  49.36 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  54.47 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  49.36 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.8 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  51.29 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  50.63 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.43 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  51.28 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  48.09 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  48.09 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  48.09 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.51 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.18 
 
 		 244 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  48.51 
 
 		 243 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  49.37 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  49.59 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  49.15 
 
 		 245 aa  215  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.73 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  48.96 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  44.35 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  50 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  47.03 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  47.41 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  44.68 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.72 
 
 		 245 aa  195  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  44.77 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  41.38 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.53 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.83 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  40.79 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  37.34 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  38.2 
 
 		 320 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 		 336 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  37.92 
 
 		 337 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 		 320 aa  139  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  40.48 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 341 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 343 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  38.35 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  37 
 
 		 320 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 315 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 		 336 aa  132  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  43.33 
 
 		 333 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  33.91 
 
 		 313 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 312 aa  131  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 		 343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.91 
 
 		 332 aa  129  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 568 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  35.37 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 		 319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 		 368 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  36.56 
 
 		 329 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 		 237 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 312 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  39.38 
 
 		 318 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>