More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0689 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  85.11 
 
 
310 aa  549  1e-155  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  85.44 
 
 
315 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  83.17 
 
 
310 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  78.25 
 
 
313 aa  508  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  76.13 
 
 
310 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  76.7 
 
 
310 aa  494  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.59 
 
 
320 aa  318  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  51.59 
 
 
320 aa  318  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  49.84 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
368 aa  311  7.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 
319 aa  311  1e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  48.57 
 
 
338 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  47.73 
 
 
320 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  48.86 
 
 
358 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  48.42 
 
 
320 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  47.4 
 
 
320 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  48.09 
 
 
336 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
338 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  48.39 
 
 
320 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  47.4 
 
 
320 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  48.41 
 
 
337 aa  294  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  46.43 
 
 
342 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  47.6 
 
 
329 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  46.73 
 
 
329 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 
320 aa  289  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  46.28 
 
 
320 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  48.06 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  45.71 
 
 
341 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  46.77 
 
 
314 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  47.12 
 
 
336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  45.3 
 
 
343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  46.28 
 
 
398 aa  284  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 
336 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 
314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  44.85 
 
 
343 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 
321 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  46.45 
 
 
329 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  46.1 
 
 
336 aa  275  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  43.09 
 
 
347 aa  275  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  43.73 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 
316 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.76 
 
 
316 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  46.18 
 
 
335 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
314 aa  264  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  45.32 
 
 
302 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 
314 aa  257  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  47.87 
 
 
333 aa  256  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  40.65 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  42.01 
 
 
568 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  41.18 
 
 
313 aa  248  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  42.95 
 
 
339 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 
343 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  40.07 
 
 
332 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  37.22 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
319 aa  222  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 
318 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
323 aa  216  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  33.44 
 
 
318 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  38.68 
 
 
328 aa  209  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
325 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
315 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  33.54 
 
 
314 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.73 
 
 
317 aa  202  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
331 aa  202  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  32.36 
 
 
317 aa  201  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
323 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
331 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  36.08 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.76 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  35.13 
 
 
326 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 
326 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.92 
 
 
327 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
234 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  34.49 
 
 
327 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.19 
 
 
322 aa  179  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.39 
 
 
327 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  34.19 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
337 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  31.56 
 
 
324 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  34.19 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.19 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.19 
 
 
322 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.08 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.08 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.08 
 
 
327 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.08 
 
 
327 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.87 
 
 
322 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.87 
 
 
322 aa  175  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  35.46 
 
 
331 aa  175  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.33 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>