More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3948 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
237 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  92.41 
 
 
237 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  58.7 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  54.78 
 
 
249 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  51.26 
 
 
243 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.84 
 
 
243 aa  234  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  50.84 
 
 
243 aa  234  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  50.84 
 
 
243 aa  234  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  50.42 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  50.42 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  49.79 
 
 
255 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  50.42 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.26 
 
 
243 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.87 
 
 
244 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  48.94 
 
 
252 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  49.79 
 
 
240 aa  224  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.78 
 
 
240 aa  222  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.86 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  48.09 
 
 
250 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.78 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  47.86 
 
 
251 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  49.34 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  50.64 
 
 
247 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 
249 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 
253 aa  217  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  49.13 
 
 
238 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  49.56 
 
 
258 aa  214  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  47.86 
 
 
245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  47.86 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 
245 aa  207  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  48.5 
 
 
247 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  48.21 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
255 aa  197  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  47.64 
 
 
250 aa  197  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  47.32 
 
 
257 aa  197  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  43.86 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  44.83 
 
 
255 aa  195  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  43.42 
 
 
240 aa  194  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  47.32 
 
 
257 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 
236 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  48.48 
 
 
247 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 
258 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  45.96 
 
 
243 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 
249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  44.64 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.43 
 
 
237 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  39.66 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
242 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.53 
 
 
240 aa  161  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
249 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  46.6 
 
 
310 aa  158  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
314 aa  158  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
319 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  41.15 
 
 
313 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  42.22 
 
 
310 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
234 aa  154  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  37.39 
 
 
313 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 
315 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  44.17 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
320 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
324 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
336 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
335 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
342 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
320 aa  148  6e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
320 aa  148  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 
310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
321 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  41.1 
 
 
341 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
320 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 
324 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
320 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 
337 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  34.96 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
344 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  40.69 
 
 
368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  35.44 
 
 
237 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13418  putative glycosyl transferase  31.22 
 
 
237 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 
337 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
237 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 
343 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
331 aa  134  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  34.35 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
336 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  39.17 
 
 
338 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
314 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
568 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  32.2 
 
 
328 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
343 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  38.75 
 
 
338 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>