More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2553 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
237 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.4 
 
 
240 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  60.09 
 
 
237 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  58.19 
 
 
240 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  56.36 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  59.48 
 
 
242 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  55.75 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 
314 aa  205  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  42.92 
 
 
319 aa  205  6e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 
320 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  41.52 
 
 
320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
324 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.03 
 
 
243 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
336 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  43.75 
 
 
314 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  42.67 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 
337 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  43.3 
 
 
314 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  40.52 
 
 
234 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  41.96 
 
 
320 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 
336 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  42.48 
 
 
321 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
568 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 
335 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  39.83 
 
 
332 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 
329 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 
320 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
312 aa  185  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  39.82 
 
 
320 aa  184  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  42.41 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 
320 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  44.2 
 
 
318 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
324 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  37.61 
 
 
320 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
316 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 
237 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 
342 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 
324 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  41.26 
 
 
337 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  41.2 
 
 
237 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 
331 aa  178  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  40.62 
 
 
314 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 
247 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
343 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.87 
 
 
249 aa  176  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 
319 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
318 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
237 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.13 
 
 
244 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  41.89 
 
 
343 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  43.91 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  39.66 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  41.25 
 
 
255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  40.25 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  43.69 
 
 
339 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  38.82 
 
 
243 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  40.61 
 
 
252 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
314 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
253 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  37.78 
 
 
325 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  40.87 
 
 
313 aa  170  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.24 
 
 
243 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
249 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  40.34 
 
 
243 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
323 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
251 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
243 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
325 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.25 
 
 
247 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.04 
 
 
243 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
243 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  37.72 
 
 
318 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  38.26 
 
 
310 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
312 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  40 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  38.96 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
341 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
323 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  41.15 
 
 
245 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  36.44 
 
 
328 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  38.7 
 
 
310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 
310 aa  164  8e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  37.28 
 
 
315 aa  164  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.73 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.6 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  37.5 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 
368 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
331 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
248 aa  161  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>