More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5120 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 323 aa  669    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  66.46 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  64.89 
 
 		 318 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  63.93 
 
 		 315 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  63.49 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  60.6 
 
 		 318 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  61.11 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  57.91 
 
 		 317 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  57.91 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  51.76 
 
 		 319 aa  352  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  47.12 
 
 		 332 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  47.71 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  44.24 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  44.38 
 
 		 323 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  42.09 
 
 		 324 aa  278  8e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  44.62 
 
 		 331 aa  276  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  45.17 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  41.93 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  43.3 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  43.65 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  41.01 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  41.39 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  39.76 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  40.52 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  40.2 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  38 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  38.49 
 
 		 329 aa  226  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  40.86 
 
 		 336 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  37.79 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.14 
 
 		 316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 368 aa  218  8.999999999999998e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  43.46 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  35.1 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  35.76 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  35.76 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  36.42 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.75 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 358 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 		 568 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  35.1 
 
 		 347 aa  205  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  41.6 
 
 		 343 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 		 398 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  34.64 
 
 		 329 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  34.56 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 		 234 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 		 337 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.24 
 
 		 237 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  38.67 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.95 
 
 		 240 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 249 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18360  putative glycosyl transferase  38.46 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.70098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1592  putative glycosyl transferase  38.01 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.357089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 		 242 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  38.05 
 
 		 237 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.89 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.88 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.88 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3635  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.338719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.88 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.88 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.88 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.55 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>