More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2546 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  83.94 
 
 		 250 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  82.33 
 
 		 252 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  80.72 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  82.73 
 
 		 252 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  79.59 
 
 		 249 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  76.54 
 
 		 245 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  67.92 
 
 		 255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  67.67 
 
 		 250 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  60.94 
 
 		 252 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  68.83 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  61.5 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  61.06 
 
 		 257 aa  284  9e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  53.53 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  58.16 
 
 		 243 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.75 
 
 		 243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  53.51 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.58 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.15 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  50.42 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  49.58 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.34 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  47.01 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  47.44 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.29 
 
 		 243 aa  222  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  49.15 
 
 		 243 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  51.75 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  47.86 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  45.92 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.38 
 
 		 244 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  46.75 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  48.77 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  49.57 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  49.57 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  45.31 
 
 		 245 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.72 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  46.98 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  45.61 
 
 		 258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.83 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  39.83 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  42.32 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.14 
 
 		 237 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.65 
 
 		 240 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3516  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0383894  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  36.48 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  37.13 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 		 320 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 320 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  37 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  39.61 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 		 336 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 		 335 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 343 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  40 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  36.56 
 
 		 320 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  38.83 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 320 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 		 342 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 237 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 324 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  35.53 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 568 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 		 331 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  39.32 
 
 		 315 aa  129  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  40.95 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  34.48 
 
 		 329 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  32.61 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 318 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 312 aa  126  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 337 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 		 314 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 329 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.05 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 344 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>