More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3977 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3977  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
243 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.242808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3884  glycosyl transferase family protein  99.18 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4087  glycosyl transferase family protein  98.77 
 
 
243 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4688  glycosyl transferase, group 2 family protein  95.47 
 
 
243 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4272  glycosyl transferase family 2  91.77 
 
 
243 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4327  glycosyl transferase family protein  91.36 
 
 
243 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4467  glycosyl transferase family protein  90.95 
 
 
252 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0072  glycosyl transferase family protein  88.37 
 
 
236 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  71.49 
 
 
243 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0284  glycosyl transferase family protein  59.07 
 
 
255 aa  310  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.422206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00384  glycosyl transferase, group 2 family protein  56.84 
 
 
244 aa  284  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3676  glycosyl transferase family protein  57.08 
 
 
238 aa  275  3e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03389  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.08 
 
 
245 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.19 
 
 
243 aa  258  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5107  glycosyl transferase family protein  54.47 
 
 
247 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1536  glycosyltransferase, group 2 family protein  53.42 
 
 
249 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.135524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5587  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.56 
 
 
247 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3863  glycosyl transferase family 2  50.42 
 
 
237 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3948  glycosyl transferase family 2  50.42 
 
 
237 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2848  glycosyl transferase family protein  50.64 
 
 
247 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0403003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3919  putative undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  48.95 
 
 
245 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  47.52 
 
 
249 aa  228  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  47.54 
 
 
253 aa  226  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02925  dolichol-phosphate mannosyltransferase  48.91 
 
 
240 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  47.01 
 
 
251 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3962  glycosyl transferase family 2  48.5 
 
 
240 aa  222  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  48.72 
 
 
252 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  48.29 
 
 
250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0976  glycosyl transferase family protein  50.22 
 
 
258 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2555  glycosyl transferase family protein  48.46 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0575182  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2388  glycosyl transferase family protein  45.11 
 
 
248 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.720423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4521  glycosyl transferase family protein  48.02 
 
 
245 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.965427  normal  0.175514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4687  glycosyl transferase family 2  48.21 
 
 
252 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1397  glycosyl transferase family protein  44.74 
 
 
240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4543  glycosyl transferase family 2  47.32 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0437708  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2163  glycosyl transferase family protein  48.47 
 
 
255 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4174  glycosyl transferase family protein  47.32 
 
 
257 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1470  dolichol-phosphate mannosyltransferase  44.3 
 
 
240 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.797995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5865  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 
250 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.612293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  43.78 
 
 
248 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1889  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 
249 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0185569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0011  glycosyl transferase family protein  42.54 
 
 
258 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.81007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6373  glycosyl transferase family 2  44.54 
 
 
247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 
243 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1778  dolichol-phosphate mannosyltransferase  41.8 
 
 
255 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  42.79 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2553  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.92 
 
 
237 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1484  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  40.26 
 
 
249 aa  164  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
240 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.7 
 
 
240 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0756  glycosyl transferase family 2  40.35 
 
 
242 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  39.39 
 
 
237 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
314 aa  145  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
336 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
343 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  35.53 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  32.77 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
310 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
343 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 
337 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3440  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 
336 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3358  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3504  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
568 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  35.78 
 
 
319 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
320 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 
368 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
312 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
333 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
314 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
320 aa  123  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
320 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
337 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
344 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
331 aa  122  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  36.12 
 
 
314 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
318 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
315 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
341 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  35.44 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
320 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
337 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  31.58 
 
 
320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  32.33 
 
 
347 aa  118  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 
314 aa  118  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>