More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1772 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  100 
 
 		 347 aa  720    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  56.62 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  56.78 
 
 		 368 aa  394  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  56.69 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  55.63 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  54.11 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  54.4 
 
 		 358 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  55.63 
 
 		 338 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.72 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  51.72 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  50.79 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  51.53 
 
 		 302 aa  325  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  43.73 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  47.45 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 		 343 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  44.2 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 		 313 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  44.84 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  45.34 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  44.69 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  46.45 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  46.08 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  43.09 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  41.48 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  45.98 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 		 336 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  46.98 
 
 		 336 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  45.77 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  44.37 
 
 		 310 aa  270  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  42.58 
 
 		 310 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  46.79 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  46.37 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  45.22 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  41.4 
 
 		 314 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  43.41 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  44.37 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  44.9 
 
 		 329 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  45.86 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  41.59 
 
 		 314 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  43.95 
 
 		 337 aa  252  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 		 316 aa  250  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.5 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  41.19 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  38.85 
 
 		 319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 568 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  35.67 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 		 315 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.8 
 
 		 317 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 314 aa  210  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  36.12 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 		 323 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  34.44 
 
 		 317 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  34.65 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 		 331 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  34.62 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2842  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 340 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.74 
 
 		 240 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  33.03 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.52 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2078  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.65 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  31.19 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.89 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.65 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.52 
 
 		 327 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1321  putative polymixin resistance glycosyltransferase transmembrane protein  32.63 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.689338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 240 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 		 326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.21 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.21 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.21 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.21 
 
 		 327 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4225  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.33 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>