More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0228 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
320 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
320 aa  649    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  59.93 
 
 
358 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  55.77 
 
 
368 aa  349  4e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  55.81 
 
 
336 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  51.72 
 
 
347 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  56.45 
 
 
398 aa  344  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  53.82 
 
 
341 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  52.83 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  52.41 
 
 
310 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  51.77 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  51.59 
 
 
312 aa  318  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  51.27 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  51.77 
 
 
338 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  48.59 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  49.52 
 
 
313 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  50.8 
 
 
315 aa  306  3e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  49.84 
 
 
310 aa  305  6e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  48.58 
 
 
319 aa  305  9.000000000000001e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  51.99 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  52.06 
 
 
337 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  51.66 
 
 
343 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  48.87 
 
 
310 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  52.06 
 
 
336 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  51.75 
 
 
320 aa  294  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  50.48 
 
 
329 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  48.43 
 
 
314 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  48.74 
 
 
314 aa  292  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  51.41 
 
 
329 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  51.74 
 
 
316 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.27 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  49.69 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  51.12 
 
 
337 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  50.32 
 
 
336 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  50.32 
 
 
336 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  50.53 
 
 
302 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
320 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  46.71 
 
 
344 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 
342 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  50.16 
 
 
318 aa  278  8e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  46.69 
 
 
334 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  49.52 
 
 
320 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  53.35 
 
 
343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  51.59 
 
 
339 aa  272  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 
320 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  46.18 
 
 
321 aa  267  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  44.37 
 
 
320 aa  265  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  46.15 
 
 
320 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  45.51 
 
 
320 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  43.91 
 
 
324 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  44.87 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
319 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  42.41 
 
 
325 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  43.79 
 
 
568 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  42.99 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  47.12 
 
 
333 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
325 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  42.72 
 
 
332 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
323 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  40.56 
 
 
337 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  42.38 
 
 
328 aa  225  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  41.8 
 
 
331 aa  226  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
331 aa  223  4e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
317 aa  218  7.999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  37.82 
 
 
313 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  38.34 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 
315 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
314 aa  210  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
318 aa  210  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
323 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
318 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
331 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  32.37 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1884  glycosyl transferase family protein  39.03 
 
 
345 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000269083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6219  glycosyl transferase family protein  39.03 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1860  glycosyl transferase family protein  39.03 
 
 
345 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5161  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
340 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1413  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
341 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  36.02 
 
 
324 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2387  putative polymixin resistance glycosyltransferase  39.35 
 
 
347 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0439  glycosyl transferase family 2  36.79 
 
 
320 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.406471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
310 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1800  glycosyl transferase family 2  39.35 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  hitchhiker  0.00270774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
318 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0433  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
320 aa  189  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1798  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
344 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1196  glycosyl transferase family 2  37.62 
 
 
331 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.452852  normal  0.209329 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1770  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
344 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.112591  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  36.16 
 
 
326 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1257  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 
331 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281246  normal  0.668936 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  38.98 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>