More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4147 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 330 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.65 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  44.41 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 		 329 aa  205  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  32.43 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 303 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  29.06 
 
 		 332 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  29.72 
 
 		 237 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.25 
 
 		 321 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 306 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 308 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  26.2 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  29.84 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.61 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 234 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  28.48 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 1171 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  26.92 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.09 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.43 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.65 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  22.7 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  22.95 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.87 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  25.41 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  23.5 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1715  protein CgeD  24.48 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000136897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  29.2 
 
 		 332 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.72 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.06 
 
 		 367 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 663 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.75 
 
 		 312 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.74 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  31.86 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.17 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 983 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 		 280 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  29.66 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.53 
 
 		 329 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  34.19 
 
 		 215 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>