More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0768 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 334 aa  673    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  36.28 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  32.53 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.59 
 
 		 321 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  36.61 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  34.97 
 
 		 339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  31.3 
 
 		 326 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.27 
 
 		 241 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 234 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.28 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.3 
 
 		 331 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  33.05 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 		 1171 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  28.33 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.74 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 242 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  26.34 
 
 		 237 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  27.69 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  32.37 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.19 
 
 		 337 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  26.45 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  24.56 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.04 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  22.54 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.58 
 
 		 643 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 		 643 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1346  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.86 
 
 		 343 aa  67  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.470467  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 		 851 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  24.9 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.36 
 
 		 643 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 		 851 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 		 851 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  24.15 
 
 		 851 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.15 
 
 		 851 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  23.02 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.83 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  21.19 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  26 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  22.08 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.47 
 
 		 643 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 756 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.53 
 
 		 254 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.94 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  27.02 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 544 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  22.68 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>