273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3932 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  62.5 
 
 		 309 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  58.75 
 
 		 307 aa  359  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 		 300 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  43.71 
 
 		 313 aa  264  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 		 298 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  36.74 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.61 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 330 aa  86.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  25.41 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  25 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.99 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.51 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.15 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  23.31 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  28.24 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  27.71 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.12 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.49 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.31 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 		 853 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.78 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.44 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.44 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  29.2 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 750 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  24.38 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 		 853 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  26.39 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 380 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 851 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 851 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 851 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 851 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  28.83 
 
 		 851 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  25.99 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.2 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 		 853 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 746 aa  53.9  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 597 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  23.87 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 573 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 320 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 930 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 360 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 847 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>