More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2530 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 313 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  47.46 
 
 		 300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1078  lipopolysaccharide biosynthesis protein  45.07 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.952222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3932  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0299205  normal  0.191145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4055  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 		 307 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2879  glycosyl transferase family protein  43.66 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.61 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 306 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.26 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  33.19 
 
 		 332 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  29.05 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  31.03 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.82 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  29.75 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  29.49 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  29.55 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.59 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.61 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  26.64 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  24.56 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.17 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 373 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.29 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.67 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1414  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.33 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.12 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  24.18 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  26.27 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.33 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  26.59 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  27.27 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  27.03 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.07 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.05 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.57 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  30.17 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.04 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 337 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 249 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>