More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3027 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  100 
 
 
237 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  50.24 
 
 
234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.18 
 
 
241 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  47.73 
 
 
242 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.55 
 
 
325 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.53 
 
 
321 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  32.39 
 
 
326 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
309 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  30 
 
 
334 aa  113  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
331 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
338 aa  105  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.42 
 
 
313 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 
325 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
252 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
341 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
349 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  30.17 
 
 
332 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  33.96 
 
 
313 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
306 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
315 aa  99.8  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
350 aa  98.2  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
324 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
312 aa  96.7  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  28.17 
 
 
313 aa  96.3  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  27.73 
 
 
332 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1451  glycosyltransferase-like protein  31.65 
 
 
290 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
334 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  30.47 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
330 aa  92.4  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
308 aa  91.7  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
348 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
298 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
334 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
303 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
310 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
373 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  40.54 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  39.34 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  28.1 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  31.47 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2530  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1334  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0703476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
663 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.04 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.38 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
581 aa  75.5  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.71 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  22.73 
 
 
331 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
338 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.51 
 
 
337 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
746 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  41.76 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0317  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.38016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
597 aa  68.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
337 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
367 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.77 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  35.79 
 
 
672 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  40.22 
 
 
374 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
329 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 
347 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
327 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>