More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6724 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
316 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  39.07 
 
 
292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  31.8 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  31.8 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  31.8 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  31.8 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  31.34 
 
 
279 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  31.34 
 
 
279 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  31.34 
 
 
279 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  31.34 
 
 
280 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  31.34 
 
 
280 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
303 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  32.11 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
289 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
209 aa  95.5  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
373 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  27.03 
 
 
325 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
321 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  30.11 
 
 
216 aa  87.4  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
209 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
374 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
812 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.44 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.5 
 
 
957 aa  80.1  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
1177 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
1177 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
581 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
746 aa  79.3  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 
1250 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  32.74 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  27.72 
 
 
672 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.8 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  31.22 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  32.74 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
316 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
209 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1015 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  31.79 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  32.74 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
327 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  33.33 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.58 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  26.09 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  42.57 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.88 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  43.88 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 
274 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
1035 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  27.54 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 
613 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  31.03 
 
 
623 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>