More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01965 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  100 
 
 
279 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  588  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  99.28 
 
 
279 aa  584  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  99.28 
 
 
279 aa  584  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  99.28 
 
 
279 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  99.64 
 
 
279 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  98.92 
 
 
279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  91.7 
 
 
303 aa  540  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  91.7 
 
 
280 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  91.7 
 
 
303 aa  540  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  91.34 
 
 
303 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  91.34 
 
 
280 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  90.18 
 
 
280 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.77 
 
 
317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.66 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
316 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
302 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.82 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
402 aa  89.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
289 aa  89  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.42 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
324 aa  87  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
351 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.82 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
249 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  42.57 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  30.3 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
597 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  40.37 
 
 
146 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  28 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  30.99 
 
 
1076 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.14 
 
 
266 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  28.34 
 
 
292 aa  79  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.13 
 
 
312 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
663 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.69 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.14 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
347 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
244 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  28.51 
 
 
292 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0132  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
403 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.227934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  35.03 
 
 
209 aa  77  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  37.37 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
320 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  28.72 
 
 
392 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.24 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.24 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
880 aa  75.5  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  35.9 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2336  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.549316  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  35.9 
 
 
309 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  35.9 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
609 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.5 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
746 aa  74.7  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  37.96 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  28.27 
 
 
1182 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>