More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02586 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  100 
 
 
292 aa  608  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
250 aa  92.4  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.5 
 
 
310 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
297 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 
255 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
235 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
302 aa  87  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 
347 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.69 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  31.32 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
1250 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  40.82 
 
 
102 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  30.39 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
573 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  25.47 
 
 
613 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  30.39 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
279 aa  79  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  28.51 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.58 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.58 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.63 
 
 
326 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.44 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  30.43 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  28.51 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  28.51 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
233 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  28.12 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.86 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  28.28 
 
 
613 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
613 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
230 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
370 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
613 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  27.27 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.18 
 
 
134 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  30.81 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
663 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  27.45 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 
351 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.18 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.18 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.36 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
373 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
235 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  34.56 
 
 
215 aa  72  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.08 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.89 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  27.54 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.62 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  42.72 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>