More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2533 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  44.76 
 
 
292 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
297 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 
317 aa  95.9  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
1250 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
289 aa  89  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.51 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.32 
 
 
310 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
1301 aa  86.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
957 aa  82.4  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  30.73 
 
 
392 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
316 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
581 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
233 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.83 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  31 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
812 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  25.85 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  31.96 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  25.96 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
1177 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
1177 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  25.85 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  25.85 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2244  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.65 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
1252 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
1252 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  25.42 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
331 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  21.1 
 
 
352 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
597 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  35.83 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
777 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  26.38 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  38.1 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  26.84 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
773 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
334 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  26.64 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  34.4 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  30.05 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  37.14 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
347 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  28.05 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>