More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02466 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  100 
 
 		 286 aa  590  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02455  glycosyltransferase  40.08 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254387  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 373 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 		 327 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.11 
 
 		 327 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.11 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.11 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 327 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 		 327 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 344 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.85 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 276 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.8 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.96 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  30.73 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.73 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  27.75 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 812 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 1250 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  28.46 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  28.11 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 544 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  30.85 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.93 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 777 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  25.89 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1217  general glycosylation pathway protein  28.88 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  30.81 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.5 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.44 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3009  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0884147  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4194  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 1035 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 351 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  30 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.44 
 
 		 957 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  30.56 
 
 		 672 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  38.79 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.7 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>