More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02455 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_02455  glycosyltransferase  100 
 
 
248 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254387  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  40.08 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
302 aa  102  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
323 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
331 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.59 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  28.09 
 
 
312 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.19 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  27.75 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
1250 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
314 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
327 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
327 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.1 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  33.15 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.1 
 
 
327 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.05 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
344 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
1035 aa  75.5  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.97 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.1 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
1562 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
397 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  24.44 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  31.35 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.27 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
1301 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
584 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1346  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.470467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
1015 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  35.66 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.93 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.48 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.51 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.38 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.23 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.83 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
362 aa  68.6  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
324 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  27.13 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  24.79 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  27.13 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  37.27 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  27.13 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  27.13 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 
323 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 
289 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
1032 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 
351 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>