More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2653 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
332 aa  656    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  67.9 
 
 
372 aa  427  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2079  glycosyl transferase family protein  38.65 
 
 
369 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.377907  normal  0.0768803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  30.5 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
305 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
302 aa  97.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.74 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  54.29 
 
 
362 aa  92.4  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
1250 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
333 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
374 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.85 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.1 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.11 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  30.24 
 
 
325 aa  86.7  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
336 aa  86.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.32 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
297 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 
266 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 
266 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.11 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  38.1 
 
 
266 aa  85.9  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 
266 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.97 
 
 
326 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  55.77 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  39.13 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.05 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  41.13 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.05 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
318 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 
351 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.79 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.63 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  29.32 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  38.02 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  41.82 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2123  CheW protein  25.41 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.266343  normal  0.676158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  49 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  43.81 
 
 
380 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
347 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
597 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
316 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.28 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  42.61 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  48.62 
 
 
1032 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.78 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
957 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.45 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
581 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.78 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  46.73 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  33.33 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  39.52 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>