More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2980 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 317 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  47.83 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  37.25 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  37.75 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  37.75 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  37.25 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  35.69 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  35.69 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  36.84 
 
 		 279 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  36.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  35.69 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  36.95 
 
 		 280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  36.95 
 
 		 280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  35.06 
 
 		 280 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.26 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 380 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 1250 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 1015 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 398 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 1177 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.84 
 
 		 1177 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.41 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 812 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 338 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 880 aa  96.3  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 581 aa  95.9  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 281 aa  95.9  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.44 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 		 402 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 294 aa  93.2  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  48.08 
 
 		 455 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  33.69 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.99 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  39.09 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 330 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.03 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  32 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  29.03 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.18 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.68 
 
 		 466 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 		 266 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 146 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  44.33 
 
 		 102 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 347 aa  89.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  43.52 
 
 		 209 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  36.84 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.18 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 249 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 350 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 339 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  36.84 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 1032 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>