More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3009 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3009  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 296 aa  607  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0884147  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  42.96 
 
 		 824 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1239  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.289253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4194  glycosyl transferase family 2  39.46 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 1250 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  28.5 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.15 
 
 		 957 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 273 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0785  hypothetical protein  25.74 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0194506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0849  putative glycosyltransferase  28.86 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0944008  decreased coverage  0.000000429095 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.7 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.93 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 		 623 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 		 613 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  27.14 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  24.66 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  30.11 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2936  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 759 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.822223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.63 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  32.32 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.73 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  23.18 
 
 		 777 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  26.87 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 343 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 281 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 1177 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  25.94 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 1177 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.1 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 756 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1716  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsA  30.6 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000743548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  25.38 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  25.2 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 727 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.55 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12971  glycosyl transferase  24.61 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  25.2 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  21.16 
 
 		 325 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  24.66 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.62 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.61 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  25.6 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  22.58 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  27.27 
 
 		 181 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>