More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  100 
 
 		 287 aa  567  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1361  cell wall membrane glycosyltransferase  43.41 
 
 		 290 aa  209  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 336 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 1177 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 		 1177 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 		 260 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 1032 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 773 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 398 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.56 
 
 		 642 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 331 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 738 aa  99  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 		 756 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 		 397 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 777 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.95 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 322 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 		 308 aa  95.9  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 544 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 318 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  30.58 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.55 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 307 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 305 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.23 
 
 		 326 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 386 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 		 655 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.77 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 660 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 380 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01361  hypothetical protein  35.37 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 253 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 314 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 330 aa  85.9  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 303 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.51 
 
 		 326 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 750 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.79 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 330 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  32.33 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3380  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 		 1301 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  27.05 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.51 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 663 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28.45 
 
 		 672 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.7 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  24.49 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  23.64 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 824 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  28.37 
 
 		 740 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 		 1476 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.08 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>