More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2704 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
336 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  43 
 
 
261 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  41.88 
 
 
253 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  43.97 
 
 
322 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  44.21 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  34.48 
 
 
272 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
293 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
1177 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
1177 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
1032 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.32 
 
 
642 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  39.59 
 
 
773 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
738 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.42 
 
 
466 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
323 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
321 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
777 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 
756 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  36.76 
 
 
289 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
1476 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.68 
 
 
312 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
318 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
330 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
235 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 
336 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
342 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
268 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  33.98 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
305 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
310 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 
339 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
305 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.84 
 
 
341 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
324 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
338 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
347 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
352 aa  92  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0309  glycosyltransferase  35.24 
 
 
318 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
727 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  33.15 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
361 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  32.4 
 
 
324 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
655 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.73 
 
 
330 aa  89  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.8 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
313 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
337 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1015 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
309 aa  86.3  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
318 aa  86.3  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
300 aa  85.9  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
374 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
684 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
597 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 
501 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
689 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  32.12 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  37.76 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
581 aa  82.4  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
623 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
398 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
379 aa  82.4  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.92 
 
 
326 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
812 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
1035 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
317 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
660 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.05 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.32 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>