132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1361 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1361  cell wall membrane glycosyltransferase  100 
 
 
290 aa  595  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11660  glycosyl transferase  43.41 
 
 
287 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
773 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
1032 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
261 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
1177 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
1177 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
756 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28 
 
 
642 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2704  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00294002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
1476 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
738 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
660 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
334 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 
689 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1251  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  26.56 
 
 
272 aa  62.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
777 aa  62.4  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1379  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.264212  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
350 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01361  hypothetical protein  35.94 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
373 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  36.88 
 
 
953 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
544 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
268 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2846  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3112  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
959 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.264403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
352 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
306 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
655 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4717  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
893 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.337059  normal  0.0164521 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
824 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
894 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
361 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
316 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  26.71 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
300 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
397 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
320 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  38.64 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  38.64 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  38.64 
 
 
344 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
281 aa  49.3  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  36.36 
 
 
344 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  25.13 
 
 
386 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
347 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 
573 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  22.7 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0411  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  35.07 
 
 
704 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
342 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
353 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
275 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.54 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 
323 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
249 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
341 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  36.36 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
983 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
333 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
313 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
1074 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  27.34 
 
 
2046 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
1250 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
326 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  26.47 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
236 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.52 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>