More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2255 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  100 
 
 		 740 aa  1538    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5481  Glycosyltransferase-like protein  26.87 
 
 		 933 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.401117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5482  hypothetical protein  25.64 
 
 		 929 aa  197  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01331  hypothetical protein  28.91 
 
 		 972 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 660 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 1177 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 1177 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.35 
 
 		 310 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 322 aa  94  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  38.46 
 
 		 785 aa  90.5  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 750 aa  88.6  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2182  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 293 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 253 aa  87.4  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 1032 aa  87.4  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 334 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 581 aa  85.9  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 		 738 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.95 
 
 		 374 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 268 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 		 321 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5479  glycosyl transferase family 2  25.06 
 
 		 655 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.98 
 
 		 295 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 777 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 233 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 261 aa  79.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0110  putative glycosyl transferase  27.39 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.755571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1156 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 		 1250 aa  77.4  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  25.95 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 		 768 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.75 
 
 		 2401 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1203  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  36.13 
 
 		 616 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.811759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.04 
 
 		 1157 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 354 aa  76.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 756 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  30.23 
 
 		 613 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  29.58 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 		 1991 aa  73.9  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 295 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 689 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 308 aa  73.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 330 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  26.46 
 
 		 296 aa  73.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  28.44 
 
 		 300 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  26.04 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 		 294 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0383  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 329 aa  72  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.91 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.51 
 
 		 642 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 880 aa  70.9  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 924 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 		 832 aa  70.1  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  40.82 
 
 		 1173 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 318 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 		 613 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 310 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 		 335 aa  70.5  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 325 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.96 
 
 		 613 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.63 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 1152 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 327 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 1152 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 983 aa  69.7  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 		 623 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.96 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  28.96 
 
 		 613 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 294 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  27.93 
 
 		 941 aa  69.3  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 		 872 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>