More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2600 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
311 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  57.63 
 
 
307 aa  332  6e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
455 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
983 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
1035 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  31.3 
 
 
708 aa  112  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
1032 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
373 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
327 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
333 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  30.87 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  44.35 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  37.41 
 
 
373 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.91 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
347 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
235 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
338 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
397 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.71 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
704 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
326 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
321 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  35.04 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
320 aa  89.4  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  41.38 
 
 
337 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 
292 aa  89  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.53 
 
 
326 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
1032 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 
347 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
581 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
334 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
544 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  35.71 
 
 
292 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.03 
 
 
326 aa  87  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 
307 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  36.29 
 
 
244 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.88 
 
 
398 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  27.51 
 
 
215 aa  85.9  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  32.28 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  38.76 
 
 
380 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  36 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  38.6 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  26.21 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
1177 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.33 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
1177 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  37.01 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0430  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.68 
 
 
642 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.54 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
597 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.91 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  24.75 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
155 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.9 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  32.86 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.23 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.73 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  34.65 
 
 
672 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.59 
 
 
367 aa  79.7  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>