More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3066 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 402 aa  833    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 362 aa  111  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 318 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  34 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  27.48 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 		 312 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 		 310 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 310 aa  99.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 1250 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.8 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 347 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 294 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 		 390 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  46.67 
 
 		 209 aa  97.1  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 351 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.75 
 
 		 326 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 1177 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 324 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 1177 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.43 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.02 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 		 256 aa  94  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 300 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 317 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 345 aa  93.2  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.78 
 
 		 326 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 326 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 333 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 299 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 		 276 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.92 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 298 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 		 279 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 		 279 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  32.81 
 
 		 279 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.7 
 
 		 321 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  37.21 
 
 		 338 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 305 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  48 
 
 		 102 aa  90.9  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 249 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  31.72 
 
 		 314 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 244 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 386 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 		 727 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.74 
 
 		 251 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 		 279 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 247 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 337 aa  89.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 264 aa  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  32.29 
 
 		 279 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 316 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  43.16 
 
 		 704 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  32.29 
 
 		 279 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 146 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 		 597 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 327 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  33.83 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 455 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  43.14 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 333 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.42 
 
 		 134 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  38.21 
 
 		 260 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  31.09 
 
 		 300 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 		 209 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 337 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  38.6 
 
 		 249 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 		 275 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 249 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 		 325 aa  86.7  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 		 280 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 		 303 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 313 aa  86.3  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 		 303 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  32.29 
 
 		 303 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 		 354 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.02 
 
 		 957 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 250 aa  85.9  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2347  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>