More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2652 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
372 aa  742    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  67.9 
 
 
332 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2079  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.377907  normal  0.0768803 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
315 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  29.84 
 
 
312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
310 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  37.85 
 
 
362 aa  94  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
302 aa  92.8  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  50.39 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.11 
 
 
266 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
266 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
266 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  33.33 
 
 
266 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
305 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 
276 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
317 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.77 
 
 
317 aa  87  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.48 
 
 
310 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  44.92 
 
 
312 aa  86.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
266 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
300 aa  86.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  38.67 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  40.74 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  46.6 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  49.52 
 
 
324 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1478  glycosyl transferase  40.78 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00283905  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
402 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  46.53 
 
 
1250 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  38.57 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.06 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  39.26 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  38.84 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 
338 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.18 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  27.55 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  39.6 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.55 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  27.55 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  41.45 
 
 
1032 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.5 
 
 
324 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.4 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  38.1 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
289 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.54 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.72 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.54 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4199  glycosyl transferase family 2  43.57 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
235 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  30.25 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
597 aa  73.2  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
347 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2123  CheW protein  23.99 
 
 
294 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.266343  normal  0.676158 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 
581 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  39.67 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  41.35 
 
 
299 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  40.95 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.2 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
663 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>