More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3932 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
302 aa  631  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  48.33 
 
 
308 aa  275  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0544  glycosyl transferase family protein  44.71 
 
 
357 aa  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0412262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
310 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2336  glycosyl transferase family protein  42.52 
 
 
285 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.549316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
581 aa  99.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2216  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
378 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.12 
 
 
251 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  38.84 
 
 
250 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  44.07 
 
 
362 aa  95.9  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  41.35 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
347 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.74 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  40.52 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.74 
 
 
266 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 
344 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 
330 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
327 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  42.16 
 
 
341 aa  89.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 
398 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
347 aa  89  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.78 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 
338 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  42.99 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 
1038 aa  87.4  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 
316 aa  87  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  40.48 
 
 
337 aa  85.9  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
324 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
350 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
337 aa  85.5  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.96 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.96 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  41.58 
 
 
102 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  37.96 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.96 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  42.48 
 
 
372 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  35.16 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  35.16 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 
347 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  35.16 
 
 
279 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  35.43 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  35.16 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.91 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  44.34 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  34.38 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  39.47 
 
 
349 aa  81.6  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  40.95 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  34.38 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0812  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.9 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0708  glycosyltransferase  44.9 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
609 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  40.57 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  28.49 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.74 
 
 
326 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  40.82 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
689 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.82 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  40.35 
 
 
1177 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  40.35 
 
 
1177 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.69 
 
 
341 aa  79  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  35.59 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
244 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
313 aa  79  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
256 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  33.33 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  33.9 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
1250 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  41.58 
 
 
134 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>