More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2336 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2336  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.549316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  42.52 
 
 
302 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4814  glycosyl transferase family 2  40.94 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.07 
 
 
317 aa  86.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.75 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  34.56 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  34.56 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  34.56 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2216  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  36.03 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  33.82 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
279 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  33.82 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
311 aa  72  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  33.08 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  31.21 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  31.11 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  38.4 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  34.56 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
386 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.99 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
1177 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
1177 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  32.5 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0544  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0412262 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  28 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
581 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  28.49 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  35.43 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2332  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
491 aa  67  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  31.09 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  35.9 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  31.52 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  27.43 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
362 aa  65.9  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
337 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
455 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.63 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.29 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.66 
 
 
927 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.66 
 
 
1115 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.66 
 
 
1119 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.71 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.03 
 
 
872 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
347 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6724  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
316 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.66 
 
 
1115 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.8 
 
 
853 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.69 
 
 
341 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.85 
 
 
853 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.48 
 
 
241 aa  63.5  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 
365 aa  63.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.5 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  37.04 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>