More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4959 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 340 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5925  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  62.65 
 
 		 331 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4812  glycosyl transferase family protein  43.79 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 		 760 aa  163  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4948  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 309 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1783  glucosyltransferase protein  38.77 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 		 325 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4593  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.734638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5934  succinoglycan biosynthesis glycosyltransferase  36.46 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2551  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1210  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.96364  normal  0.0584943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4601  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1970  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0816674 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2552  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1211  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.476178  normal  0.091183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4525  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.070536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.02 
 
 		 941 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 		 338 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  35.38 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 		 250 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.67 
 
 		 251 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 455 aa  90.9  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 		 310 aa  90.5  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  46.23 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  30.88 
 
 		 672 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1210  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  31.42 
 
 		 946 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255767  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.22 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  33.85 
 
 		 637 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 327 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 		 351 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 689 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  29.8 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3932  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.11 
 
 		 326 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  42 
 
 		 609 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  43.48 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  31.76 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.27 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.66 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.26 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.26 
 
 		 327 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.88 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  43.81 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2494  glycosyl transferase family protein  46.46 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0194335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 		 1250 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  39.62 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  28.7 
 
 		 1157 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  46.3 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.06 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.06 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  29.8 
 
 		 1014 aa  80.1  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  41.44 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.02 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  45.26 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2495  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 		 325 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.16 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>