More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0209 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  100 
 
 
102 aa  209  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  53.54 
 
 
255 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  52.48 
 
 
249 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  54.46 
 
 
249 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  50.51 
 
 
209 aa  110  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  50.52 
 
 
398 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  49.49 
 
 
327 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  54.17 
 
 
250 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  52.13 
 
 
317 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  53.76 
 
 
302 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.48 
 
 
254 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
244 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
374 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  49.5 
 
 
299 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  48.45 
 
 
390 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  47 
 
 
380 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.47 
 
 
266 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  51.02 
 
 
1038 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  47.92 
 
 
386 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  52.69 
 
 
347 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
290 aa  98.2  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  49.48 
 
 
362 aa  98.6  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.45 
 
 
266 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  48.96 
 
 
309 aa  97.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0314  glycosyl transferase family protein  49.47 
 
 
323 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.06758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.42 
 
 
266 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.42 
 
 
266 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.42 
 
 
266 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  48.42 
 
 
266 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  48.45 
 
 
310 aa  96.7  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  49.49 
 
 
326 aa  95.9  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.39 
 
 
253 aa  96.7  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  47.92 
 
 
309 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  46.88 
 
 
353 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  48.91 
 
 
301 aa  95.5  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  47.37 
 
 
297 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  52.13 
 
 
277 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1450  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  47.47 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.069354  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  47.92 
 
 
309 aa  95.9  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  45.16 
 
 
325 aa  95.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  44.44 
 
 
321 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  48.48 
 
 
312 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  42.55 
 
 
252 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 
326 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  46.94 
 
 
326 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.39 
 
 
251 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  45.54 
 
 
306 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  47.87 
 
 
310 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  47.47 
 
 
326 aa  94  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  48.51 
 
 
310 aa  93.6  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  46.94 
 
 
230 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  43.88 
 
 
209 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  47.47 
 
 
326 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 
264 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
280 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  48.94 
 
 
373 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  48.42 
 
 
597 aa  92  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  50 
 
 
216 aa  92.4  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  51.09 
 
 
344 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  46.74 
 
 
397 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  44.12 
 
 
573 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
313 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  46.39 
 
 
280 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  44.9 
 
 
1250 aa  92  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1433  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.44 
 
 
340 aa  91.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.835917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  45.65 
 
 
309 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  46.46 
 
 
209 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  48 
 
 
402 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  45.65 
 
 
295 aa  90.9  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  44.68 
 
 
327 aa  90.5  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  46.74 
 
 
287 aa  90.5  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  47.92 
 
 
306 aa  90.5  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.71 
 
 
350 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  40.22 
 
 
1157 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  47.87 
 
 
321 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 
303 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  48.89 
 
 
348 aa  89.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  44.79 
 
 
372 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  44.79 
 
 
300 aa  89.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  46.94 
 
 
217 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  44.33 
 
 
317 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 
326 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  42.86 
 
 
338 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  45.92 
 
 
330 aa  89  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  45.16 
 
 
296 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 
337 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0910  glycosyl transferase  42.86 
 
 
212 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  43.43 
 
 
215 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  44.57 
 
 
366 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
289 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  46.24 
 
 
609 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  46.32 
 
 
289 aa  89  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  45.36 
 
 
235 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  45.65 
 
 
269 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  44.09 
 
 
343 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  44.68 
 
 
256 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  43.88 
 
 
292 aa  87.8  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  43.01 
 
 
249 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>