188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2123 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2123  CheW protein  100 
 
 		 294 aa  604  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.266343  normal  0.676158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3066  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  26.9 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2079  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.377907  normal  0.0768803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.37 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.04 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.04 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.56 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 351 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  23.67 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2025  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  hitchhiker  0.00838436 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 321 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  28.57 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 230 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.63 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 		 351 aa  52.4  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.71 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  33.03 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 325 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2187  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.76 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  23.42 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 455 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  31.9 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.9 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  27.32 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  29.46 
 
 		 311 aa  49.3  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 349 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 325 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  32.35 
 
 		 613 aa  48.9  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.85 
 
 		 253 aa  48.9  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  29.91 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 1250 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.83 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 		 327 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 573 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.37 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 581 aa  46.6  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 390 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 		 373 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 249 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  31.63 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 322 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 209 aa  45.8  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 397 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  30.39 
 
 		 613 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>