More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1841 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
306 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  91.8 
 
 
318 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  59.41 
 
 
525 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  53.29 
 
 
301 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7660  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  51.62 
 
 
303 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1482  glycosyl transferase family 2  49.67 
 
 
301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8598  glycosyl transferase family protein  47.32 
 
 
313 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.740895  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 
672 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
303 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
289 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
235 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
264 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.49 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
597 aa  82.4  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  37.4 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1239  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.289253  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.53 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.57 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.12 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.5 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  40 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  42.15 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  26.54 
 
 
321 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  26.4 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  35.92 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  35.92 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  40.18 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  35.92 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  40.18 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  40.18 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.4 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
347 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  40.18 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  40.18 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2673  putative glycosyl transferase  38.18 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
1250 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  37.38 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3373  glycosyl transferase family 2  31.44 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  47.32 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  31.25 
 
 
267 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  36.94 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  36.94 
 
 
279 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  36.94 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  36.94 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
1035 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  36.94 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  48.57 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  36.94 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  39.66 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 
327 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
286 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
261 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>