More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3973 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
525 aa  1032    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1832  glycosyl transferase family protein  59.29 
 
 
318 aa  340  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.52931  hitchhiker  0.00130568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1841  glycosyl transferase family protein  59.41 
 
 
306 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7660  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  54.64 
 
 
303 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1482  glycosyl transferase family 2  51.5 
 
 
301 aa  282  9e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  49.5 
 
 
301 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8598  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
313 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.740895  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1831  glycosyltransferase family 28 protein  42.93 
 
 
213 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.627696  hitchhiker  0.00418899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1840  glycosyltransferase family 28 protein  41.18 
 
 
222 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
325 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 
672 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
303 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5300  D-glucuronyl C5-epimerase domain protein  39.06 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1064  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
163 aa  75.1  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
832 aa  75.1  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.16 
 
 
367 aa  72.8  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 
398 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3698  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.1 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
597 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1151  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695436  hitchhiker  0.0000000000708662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1239  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.289253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4194  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.81 
 
 
310 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.65 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
1250 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
326 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1169  glycosyl transferase CpsG(V)  31.58 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  35.65 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.5 
 
 
326 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.5 
 
 
326 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  24.29 
 
 
321 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.5 
 
 
321 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8503  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
280 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396799  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
321 aa  66.6  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.56 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
322 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2885  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
345 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.37137  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
276 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2653  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 
332 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.106292  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  27.97 
 
 
311 aa  65.1  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
310 aa  64.7  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
275 aa  63.9  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
318 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
233 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
294 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
310 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  29.63 
 
 
312 aa  63.5  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
333 aa  63.5  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
331 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
311 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  27.98 
 
 
292 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.27 
 
 
312 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
280 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
300 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3668  Glycosyltransferase 28 domain  33.97 
 
 
313 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
327 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
351 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
338 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
310 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
333 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.52 
 
 
292 aa  62  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.91 
 
 
330 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 
309 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
390 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
266 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
584 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  27.69 
 
 
266 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
265 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
266 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 
326 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
318 aa  60.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
315 aa  60.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2603  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 
824 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.780647  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.52 
 
 
341 aa  60.5  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5095  glycosyltransferase family 28 protein  32.88 
 
 
173 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
281 aa  60.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 
266 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
347 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  31.07 
 
 
309 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  25.41 
 
 
260 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
314 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
247 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
342 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  38.71 
 
 
753 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>