More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1493 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
286 aa  594  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  48.75 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  42.98 
 
 
274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  43.19 
 
 
278 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
268 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
605 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  37.99 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  42.54 
 
 
329 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  39.91 
 
 
342 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  38.06 
 
 
296 aa  155  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 
297 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  39.91 
 
 
1037 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  42.64 
 
 
310 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  42.05 
 
 
310 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
331 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
271 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
327 aa  148  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 
974 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 
1562 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  39.64 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
701 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  34.89 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
265 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
256 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  37.08 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
261 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
266 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 
718 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
235 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  36.55 
 
 
249 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
328 aa  123  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  28.72 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
335 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
269 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
320 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
257 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
299 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
274 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
337 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2601  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
272 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4596  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
270 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
258 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  33.77 
 
 
672 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  27.91 
 
 
274 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
930 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
325 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.36 
 
 
310 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
1032 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.63 
 
 
312 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
280 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.15 
 
 
294 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
597 aa  95.5  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  28.76 
 
 
316 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
327 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.78 
 
 
295 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
812 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4435  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.880972  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
252 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
248 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2345  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
246 aa  92.8  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3219  glycosyl transferase family protein  46.74 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 
293 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.02 
 
 
294 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2879  hypothetical protein  28.94 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4300  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
331 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 
1035 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
333 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
334 aa  89.4  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
321 aa  89.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
318 aa  89  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
314 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
305 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>