More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3185 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
266 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2099  glycosyl transferase, family 2  53.18 
 
 
267 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1158  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 
284 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  37.26 
 
 
254 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
288 aa  122  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
296 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0526  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
297 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1581  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
273 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.399238  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3806  glycosyl transferase family protein  32.55 
 
 
605 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 
294 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
256 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
294 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
268 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3720  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
974 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
261 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1874  hypothetical protein  32.42 
 
 
249 aa  102  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.953191 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.69 
 
 
274 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1549  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
285 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572491  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  31.84 
 
 
318 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3170  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
327 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 
261 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1960  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
260 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  33.17 
 
 
325 aa  98.2  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  31.53 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3252  glycosyl transferase family 2  33.13 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.180036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3053  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0250  glycosyl transferase family 2  34.44 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2781  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
295 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.217678 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3037  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
718 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
249 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2592  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4048  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
347 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1232  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
1037 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
1035 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1152  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
269 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
335 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
333 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
363 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
322 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3798  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  41.79 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0892  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0398957  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2769  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.14 
 
 
329 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1316  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
248 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
323 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
727 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2515  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.467917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
320 aa  85.9  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
1562 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2596  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
320 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
331 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2574  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51220  glycosyl transferase  30.09 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00120111  hitchhiker  0.000215045 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
361 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0726  putative glycosyltransferase protein  30.89 
 
 
349 aa  82  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
701 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
230 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1543  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
247 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  27.11 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0310  glycosyl transferase family protein  49.44 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0112917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3889  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  25.55 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  32.8 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
1177 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
1177 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4931  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2632  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0959  Cps2I  49.4 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
336 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  32.5 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.04 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4864  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.190985  normal  0.0685373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>